Centrum Edukacji Ekologicznej w Brodnicy usytuowane jest w XVII. wiecznym spichlerzu. Głównym celem Centrum to ukazanie piękna i promocja walorów przyrodniczych Pojezierza Brodnickiego oraz edukacja przyrodnicza i ekologiczna społeczeństwa, prowadząca do lepszego poznania i tym samym większego poszanowania lokalnej przyrody. Na wystawie można zobaczyć cztery zbiorniki akwariowe w których zaprezentowano ryby lokalnej ichtiofauny jak i pozostałe organizmy wodne. Zbiorniki możemy oglądać z dwóch stron. W pierwszym zbiorniku zamieszkuje węgorz oraz sumy, w drugim jesiotry, w trzecim różnorodne ryby typu: płoć, amur, karaś. W czwartym najmniejszym zamieszkują raki. Sum pospolity – Silurus glanis Jesiotry – Acipenser ruthenus
Młode sandacze – Sander lucioperca Amur – Ctenopharyngodon idellaLin – Tinca tinca Karaś – Carassius carassiusJaź- Leuciscus idus Rak schowany był w grocie. W muzeum możemy zobaczyć wiele innych eksponatów ukazujących piękno fauny i flory tego regionu.
Główną siedzibą jest barokowy spichlerz z XVII wieku. Ponadto ekspozycje znajdują się w dwóch innych obiektach: podziemiach krzyżackiego zamku z XIV wieku oraz Bramie Chełmińskiej.